Noutati

Incepand cu 15.12.2017, Institutul de Biochimie al Academiei Romane are placerea de a invita furnizori de echipamente IT la procedura de achizitii publice pentru proiectul “Sistem de predictie bazat pe integrare multi-omics pentru prioritizarea interventiilor gerontologice - GERONTOMICS”.

Invitatia de participare poate fi accesata prin intermediul SEAP, e-licitatie.ro. Numarul invitatiei/anuntului: 419933 / 15.12.2017.

CINE SUNTEM

Grupul de Biologie Computationala a Imbatranirii a fost fondat in 2016, de catre Dr. Robi Tacutu si face parte din departmentul de Bioinformatica si Biochimie Structurala din cadrul Institutului de Biochimie al Academiei Romane. In acest moment suntem finantati printr-un grant European (2 million EURO), obtinut recent pentru proiectul “Sistem de predicție bazat pe integrare multi-omics pentru prioritizarea intervențiilor gerontologice”, iar principalele zone de interes ale grupului includ biogerontologia, biologia sistemelor si bioinformatica.

Avand o echipa multi-disciplinara, proiectele noastre include atat aspecte computationale (agregare si procesare de date, analiza de date multidimensionale, metode bioinformatice bazate pe grafuri, metode de teoria sistemelor, invatare automata, etc.), precum si experimente de laborator (in particular testare in-vivo a interventiilor genetice prezise computational).

Pentru mai multe detalii despre Gerontomics, vizitati pagina proiectului.

CONTEXT GENERAL

Îmbătrânirea organismului este un proces biologic definit printr-o pierdere progresivă a viabilității și o creștere exponențială a fragilității. Varsta este de asemenea principalul factor de risc pentru multe patologii, inclusiv cele mai multe tipuri de cancer, boli cardiovasculare, diabet tip 2, boli neurodegenerative, etc. Aceasta conexiune nu este deloc surprinzatoare, deoarece la nivel molecular, bolile asociate senectutii au multe componente genetice si cai moleculare in comun cu asa zisul proces de imbatranire “normal”.

Una dintre provocarile biologice/biomedicale majore cu care societatea de azi se confrunta este incercarea de a intelege mai bine procesul de imbatranire, si mecanismele care il determina. Orice progres in acest sens poate rezulta in beneficii socio-economice foarte mari prin cresterea capacitatii de a extinde durata de viata si poate mai important durata de sanatate/healthspan (i.e. intervalul de ani sanatosi si productivi din viata unei persoane).

Datorita progresului din domeniul tehnologiilor high-throughput, multe dintre aspectele moleculare ale imbătrânirii pot fi acum ușor analizate la diferite niveluri “omics” (e.g.: genomic, transcriptomic, epigenomic, etc), folosind o gamă largă de modele și pornind de la diferite ipoteze (e.g.: analiza imbatranirii fiziologice, a mutanților longevivi și/sau cu durată scurtă de viață, a animalelor restricționate caloric, etc). Este de la sine inteles ca aceste seturi de date sunt extrem de valoroase pentru cercetare, dar potentialul utilizarii lor ar fi cu siguranta si mai mare daca datele ar fi analizate combinat, per ansamblu. Din pacate insa, la nivel de integrare a datelor, eforturi considerabile sunt inca necesare pentru a obtine o astfel de abordare: formarea unei perspective de ansamblu care sa explice cum sunt interconectate toate aceste masuratori moleculare si mai mult, cum rezultatul comun al modificarilor observate se poate manifesta fenotipic sub forma de imbatranire/boli asociate senectutii. Un astfel de model integrativ, impreuna cu folosirea metodelor de analiza a sistemelor biologice are o importanta majora si va ajuta la maximizarea cunostintelor pe care le putem obtine din studii experimentale gerontologice.

MISIUNE SI OBIECTIVE

Misiunea noastra este utilizarea si dezvoltarea de unelte computationale, cu scopul de a cerceta si de a intelege mai bine procesul imbatranirii. In acelasi timp urmarim si dezvoltarea de terapii biotehnologice si farmacologice pentru translatarea rezultatelor teoretice obtinute pe calculator catre laborator si in final catre domeniul medical.

Obiectivele noastre in acest moment sunt 1) integrarea si analiza seturilor de date obtinute pe scara larga la diferite niveluri biologice (incluzand de exemplu genomica, transcriptomica and epigenomica); 2) folosirea metodelor moderne de biologie a sistemelor, network biology, invatare automata, si inteligenta artificiala, pentru a crea modele matematice si computationale ale procesului de imbatranire; si 3) folosirea acestor date, modele si algoritmi, pentru a prezice noi interventii genetice si epigenetice cu potential ridicat in modularea lifespan-ului si al healthspan-ului in organisme model.

Pentru mai multe informatii despre proiectele noastre, colaborari sau intrebari despre posturile/stagiile disponibile in grupul nostru, trimiteti-ne un mesaj pe pagina noastra de contact.

FINANTARE

Instrumente Structurale Grupul nostru doreste sa multumeasca pentru sustinerea financiara generoasa EU-RO primita prin Programul Operational Competitivitate 2014-2020, POC-A.1-A.1.1.4-E-2015.

Microsoft Our group would like to also thank Microsoft for the Azure Research sponsorship (cloud computing resources) awarded to our group.

nVidia We gratefully acknowledge the support of NVIDIA Corporation with the donation of the Titan Xp GPU used for our research.

Conţinutul acestui material nu reprezintă în mod obligatoriu poziţia oficială a Uniunii Europene sau a Guvernului României.

Pentru informaţii detaliate despre celelalte programe cofinanţate de Uniunea Europeană, vă invităm să vizitaţi www.fonduri-ue.ro.